Bonjour
Non, à ma connaissance, le Javascript n'étant pas (correctement) interprété par les moteurs, il n'y a pas de risques ...
Facteur bloquant, non, en effet. Mais freinant éventuellement, en cas d'abondance de script en haut de page de code, le vrai contenu se trouvant relégué plus bas.
Il est possible, comme pour les CSS, d'avoir des scripts externes, pour contrer l'inconvénient déjà cité, et alléger la page.
Cordialement.